Liga de Honra 
| P | W | D | L | GF | - | GA | Pts | GD | ||
| 1. | CD Santa Clara | 256 | 99 | 75 | 82 | 310 | - | 289 | 372 | (+21) |
| 2. | CD Aves | 226 | 84 | 80 | 62 | 272 | - | 233 | 332 | (+39) |
| 3. | CD Feirense | 226 | 88 | 62 | 76 | 282 | - | 245 | 326 | (+37) |
| 4. | GD Estoril Praia | 214 | 76 | 69 | 69 | 258 | - | 233 | 297 | (+25) |
| 5. | Portimonense SC | 226 | 73 | 76 | 77 | 258 | - | 268 | 295 | (-10) |
| 6. | Leixões SC | 166 | 74 | 50 | 42 | 208 | - | 137 | 272 | (+71) |
| 7. | CD Trofense | 192 | 70 | 56 | 66 | 224 | - | 225 | 266 | (-1) |
| 8. | FC Penafiel | 192 | 62 | 59 | 71 | 204 | - | 224 | 245 | (-20) |
| 9. | Varzim SC | 184 | 57 | 64 | 63 | 202 | - | 223 | 235 | (-21) |
| 10. | UD Oliveirense | 162 | 59 | 48 | 55 | 190 | - | 182 | 225 | (+8) |
| 11. | Gil Vicente FC | 150 | 57 | 55 | 38 | 197 | - | 168 | 217 | (+29) |
| 12. | SC Freamunde | 192 | 51 | 62 | 79 | 236 | - | 288 | 215 | (-52) |
| 13. | SC Covilhã | 196 | 50 | 64 | 82 | 205 | - | 262 | 214 | (-57) |
| 14. | SC Beira-Mar | 124 | 52 | 43 | 29 | 151 | - | 113 | 199 | (+38) |
| 15. | SC Olhanense | 124 | 53 | 36 | 35 | 155 | - | 124 | 195 | (+31) |
| 16. | CF Os Belenenses | 102 | 46 | 30 | 26 | 139 | - | 109 | 168 | (+30) |
| 17. | Vizela | 124 | 40 | 45 | 39 | 139 | - | 134 | 165 | (+5) |
| 18. | Gondomar | 124 | 42 | 35 | 47 | 154 | - | 142 | 161 | (+12) |
| 19. | FC Arouca | 102 | 39 | 33 | 30 | 144 | - | 125 | 150 | (+19) |
| 20. | Moreirense FC | 94 | 36 | 26 | 32 | 119 | - | 110 | 134 | (+9) |
| 21. | Rio Ave FC | 60 | 28 | 20 | 12 | 82 | - | 63 | 104 | (+19) |
| 22. | Naval 1° de Maio | 72 | 25 | 28 | 19 | 91 | - | 83 | 103 | (+8) |
| 23. | GD Chaves | 94 | 22 | 28 | 44 | 84 | - | 116 | 94 | (-32) |
| 24. | CF União Madeira | 72 | 22 | 27 | 23 | 82 | - | 86 | 93 | (-4) |
| 25. | CD Fátima | 90 | 18 | 32 | 40 | 85 | - | 121 | 86 | (-36) |
| 26. | Atlético CP | 72 | 21 | 18 | 33 | 72 | - | 99 | 81 | (-27) |
| 27. | Sporting CP II | 42 | 17 | 15 | 10 | 62 | - | 47 | 66 | (+15) |
| 28. | SL Benfica II | 42 | 15 | 17 | 10 | 71 | - | 54 | 62 | (+17) |
| 29. | CD Tondela | 42 | 16 | 11 | 15 | 55 | - | 60 | 59 | (-5) |
| 30. | Vitória SC Guimarães | 30 | 16 | 7 | 7 | 44 | - | 20 | 55 | (+24) |
| 31. | União de Leiria | 30 | 15 | 9 | 6 | 46 | - | 29 | 54 | (+17) |
| 32. | FC Porto II | 42 | 13 | 15 | 14 | 49 | - | 49 | 54 | (+0) |
| 33. | SC Braga II | 42 | 12 | 14 | 16 | 39 | - | 48 | 50 | (-9) |
| 34. | CS Marítimo II | 42 | 14 | 7 | 21 | 40 | - | 46 | 49 | (-6) |
| 35. | Vitória Guimarães II | 42 | 7 | 15 | 20 | 30 | - | 56 | 36 | (-26) |
| 36. | Barreirense | 34 | 8 | 11 | 15 | 31 | - | 41 | 35 | (-10) |
| 37. | Boavista FC | 30 | 9 | 5 | 16 | 28 | - | 44 | 32 | (-16) |
| 38. | Marco | 34 | 7 | 8 | 19 | 31 | - | 63 | 29 | (-32) |
| 39. | Oliv. Moscavide | 30 | 7 | 6 | 17 | 26 | - | 42 | 27 | (-16) |
| 40. | Ovarense | 34 | 6 | 7 | 21 | 36 | - | 72 | 25 | (-36) |
| 41. | AD Carregado | 30 | 6 | 6 | 18 | 26 | - | 47 | 24 | (-21) |
| 42. | Maia | 34 | 6 | 6 | 22 | 30 | - | 67 | 24 | (-37) |
Point changes:
| 2006-07 | Gil Vicente FC | -9 |
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